| 17. Spieltag | 29.01.2006 | Atromitos | - | PAOK Saloniki | 2:1 | ||||
| 18. Spieltag | 05.02.2006 | OFI Heraklion | - | Atromitos | 0:0 | ||||
| 19. Spieltag | 12.02.2006 | Atromitos | - | Apollon Kalamarias | 1:1 | ||||
| 20. Spieltag | 19.02.2006 | Skoda Xanthi | - | Atromitos | 1:0 | ||||
| 22. Spieltag | 05.03.2006 | Atromitos | - | Iraklis Saloniki | 3:2 | ||||
| 23. Spieltag | 11.03.2006 | AO Egaleo | - | Atromitos | 0:1 | ||||
| 24. Spieltag | 19.03.2006 | Atromitos | - | AE Lárissa | 0:0 | ||||
| 25. Spieltag | 27.03.2006 | Olympiakos Piraeus | - | Atromitos | 3:0 | ||||
| 26. Spieltag | 02.04.2006 | Atromitos | - | Ionikos Nikea | 3:2 | ||||
| 27. Spieltag | 09.04.2006 | Panathinaikos | - | Atromitos | 4:3 |  |
|||
| 29. Spieltag | 30.04.2006 | Atromitos | - | GS Kallithea | 2:1 | |
|||
| 30. Spieltag | 14.05.2006 | Akratitos Liosion | - | Atromitos | 0:2 |  |
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