| 1. Spieltag | 28.02.2025 | FCI Levadia | - | Harju JK | 5:0 | ||||
| 2. Spieltag | 09.03.2025 | Harju JK | - | JK Tallinna Kalev | 2:0 | ||||
| 3. Spieltag | 16.03.2025 | FC Kuressaare | - | Harju JK | 1:2 | ||||
| 5. Spieltag | 05.04.2025 | Pärnu JK Vaprus | - | Harju JK | 1:1 | ||||
| 6. Spieltag | 09.04.2025 | JK Nõmme Kalju | - | Harju JK | 3:0 | ||||
| 7. Spieltag | 12.04.2025 | Harju JK | - | Paide Linnameeskond | 1:2 | ||||
| 8. Spieltag | 18.04.2025 | Harju JK | - | JK Tammeka | 4:1 | ||||
| 9. Spieltag | 22.04.2025 | FC Flora | - | Harju JK | 4:1 | ||||
| 10. Spieltag | 26.04.2025 | Harju JK | - | Pärnu JK Vaprus | 0:1 | ||||
| 11. Spieltag | 03.05.2025 | JK Tallinna Kalev | - | Harju JK | 1:3 |  |
|||
| 12. Spieltag | 09.05.2025 | Harju JK | - | FC Flora | 0:3 | |
|||
| 13. Spieltag | 17.05.2025 | Paide Linnameeskond | - | Harju JK | 2:2 | |
|||
| 15. Spieltag | 31.05.2025 | Harju JK | - | FCI Levadia | 0:1 | ||||
| 16. Spieltag | 13.06.2025 | JK Tammeka | - | Harju JK | 2:1 | ||||
| 17. Spieltag | 18.06.2025 | JK Nõmme Kalju | - | Harju JK | 1:0 |
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