| 6. Spieltag | 17.09.2016 | GVVV | - | Jong FC Twente | 0:0 | ||||
| 7. Spieltag | 25.09.2016 | Jong FC Twente | - | VV Sint Bavo | 0:2 | ||||
| 10. Spieltag | 15.10.2016 | VV Katwijk | - | Jong FC Twente | 0:1 | ||||
| 11. Spieltag | 29.10.2016 | Jong FC Twente | - | HHC Hardenberg | 0:1 | ||||
| 13. Spieltag | 12.11.2016 | Jong FC Twente | - | Excelsior Maassluis | 1:2 | ||||
| 14. Spieltag | 20.11.2016 | Jong FC Twente | - | VV UNA | 1:3 |  |
|||
| 15. Spieltag | 27.11.2016 | De Treffers | - | Jong FC Twente | 2:1 | ||||
| 18. Spieltag | 18.12.2016 | Amsterdamsche FC | - | Jong FC Twente | 4:0 | ||||
| 19. Spieltag | 16.01.2017 | Jong FC Twente | - | Vitesse (J) | 1:5 | ||||
| 21. Spieltag | 28.01.2017 | Jong FC Twente | - | GVVV | 3:1 | ||||
| 24. Spieltag | 20.02.2017 | AZ Alkmaar (J) | - | Jong FC Twente | 1:0 | ||||
| 20. Spieltag | 24.02.2017 | TEC VV | - | Jong FC Twente | 3:0 | ||||
| 25. Spieltag | 05.03.2017 | VV UNA | - | Jong FC Twente | 3:1 | ||||
| 33. Spieltag | 06.05.2017 | Jong FC Twente | - | FC Lienden | 0:1 | ||||
| 34. Spieltag | 13.05.2017 | Koninklijke HFC | - | Jong FC Twente | 0:1 |
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