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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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Spartak Trnava | 10 | 8 | 0 | 2 | 20:8 | 12 | 24 |
| 2 |
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FC DAC 1904 | 11 | 5 | 4 | 2 | 14:11 | 3 | 19 |
| 3 |
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AS Trenčín | 10 | 4 | 4 | 2 | 27:16 | 11 | 16 |
| 4 |
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Slovan Bratislava | 10 | 3 | 4 | 3 | 18:15 | 3 | 13 |
| 5 |
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MFK Ružomberok | 10 | 3 | 4 | 3 | 13:11 | 2 | 13 |
| 6 |
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FC Nitra | 11 | 2 | 5 | 4 | 10:10 | 0 | 11 |
| 7 |
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MŠK Žilina | 10 | 3 | 0 | 7 | 13:25 | -12 | 9 |
| 8 |
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MFK Zemplín Michalovce | 11 | 2 | 2 | 7 | 7:14 | -7 | 8 |
| 9 |
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1. FC Tatran Prešov | 11 | 2 | 1 | 8 | 8:20 | -12 | 7 |
| 10 |
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Zlaté Moravce | 11 | 1 | 3 | 7 | 7:19 | -12 | 6 |
| 11 |
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FK Železiarne Podbrezová | 10 | 1 | 1 | 8 | 5:16 | -11 | 4 |
| 12 |
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FK Senica | 11 | 0 | 3 | 8 | 7:27 | -20 | 3 |
| Playoffs | |
| Relegation |
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# Spartak Myjava zog sich im Januar 2017 aufgund finanzieller Probleme aus dem laufenden Wettbewerb zurück. In der Saison 2017/2018 sollte eigentlich VSS Košic nachrücken, ging aber ebenfalls pleite. Daher tritt nun der FC Nitra an. |
