| 16. Spieltag | 26.01.2003 | Ionikos Nikea | - | Panionios GSS | 1:2 |  |
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| 17. Spieltag | 02.02.2003 | Panionios GSS | - | Aris Saloniki | 1:0 | ||||
| 18. Spieltag | 09.02.2003 | Panachaiki GE | - | Panionios GSS | 0:2 | |
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| 19. Spieltag | 16.02.2003 | Iraklis Saloniki | - | Panionios GSS | 3:1 | ||||
| 20. Spieltag | 22.02.2003 | Panionios GSS | - | AO Egaleo | 1:0 | ||||
| 21. Spieltag | 01.03.2003 | PAS Giannina | - | Panionios GSS | 1:2 | ||||
| 23. Spieltag | 15.03.2003 | Skoda Xanthi | - | Panionios GSS | 0:1 | ||||
| 24. Spieltag | 23.03.2003 | Panionios GSS | - | GS Kallithea | 2:0 |  |
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| 25. Spieltag | 06.04.2003 | OFI Heraklion | - | Panionios GSS | 1:1 | ||||
| 26. Spieltag | 13.04.2003 | Panionios GSS | - | Olympiakos Piraeus | 0:0 | ||||
| 27. Spieltag | 20.04.2003 | Panionios GSS | - | Akratitos Liosion | 1:1 | ||||
| 28. Spieltag | 03.05.2003 | PAOK Saloniki | - | Panionios GSS | 3:0 | ||||
| 29. Spieltag | 10.05.2003 | Panionios GSS | - | AO Proodeftiki | 2:0 | ||||
| 30. Spieltag | 25.05.2003 | AEK Athen | - | Panionios GSS | 4:2 |
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