| Gruppe J | 15.09.2011 | FC Steaua Bucureşti | - | FC Schalke 04 | 0:0 | ||||
| Gruppe J | 29.09.2011 | FC Schalke 04 | - | Maccabi Haifa | 3:1 |  |
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| Gruppe J | 20.10.2011 | AEK Larnaca | - | FC Schalke 04 | 0:5 | ||||
| Gruppe J | 03.11.2011 | FC Schalke 04 | - | AEK Larnaca | 0:0 | ||||
| Gruppe J | 01.12.2011 | FC Schalke 04 | - | FC Steaua Bucureşti | 2:1 | ||||
| 2. Runde | 16.02.2012 | Viktoria Plzeň | - | FC Schalke 04 | 1:1 |  |
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| 2. Runde | 23.02.2012 | FC Schalke 04 | - | Viktoria Plzeň | 3:1 n.V. | ||||
| Achtelfinale | 08.03.2012 | FC Twente | - | FC Schalke 04 | 1:0 | ||||
| Achtelfinale | 15.03.2012 | FC Schalke 04 | - | FC Twente | 4:1 | |
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| Viertelfinale | 29.03.2012 | FC Schalke 04 | - | Athletic Club | 2:4 |
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