| 15. Spieltag | 21.10.2006 | Carlisle United | - | Tranmere Rovers | 1:0 |  |
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| 28. Spieltag | 13.01.2007 | Bristol City | - | Tranmere Rovers | 3:2 | ||||
| 32. Spieltag | 10.02.2007 | Tranmere Rovers | - | Doncaster Rovers | 1:0 | ||||
| 33. Spieltag | 17.02.2007 | Yeovil Town | - | Tranmere Rovers | 0:2 | ||||
| 35. Spieltag | 24.02.2007 | Leyton Orient | - | Tranmere Rovers | 3:1 | ||||
| 39. Spieltag | 24.03.2007 | AFC Bournemouth | - | Tranmere Rovers | 2:0 | ||||
| 41. Spieltag | 07.04.2007 | Blackpool FC | - | Tranmere Rovers | 3:2 | ||||
| 42. Spieltag | 09.04.2007 | Tranmere Rovers | - | Brighton & Hove Albion | 2:1 | ||||
| 43. Spieltag | 14.04.2007 | Millwall FC | - | Tranmere Rovers | 2:2 | ||||
| 44. Spieltag | 21.04.2007 | Tranmere Rovers | - | Scunthorpe United | 0:2 | ||||
| 45. Spieltag | 28.04.2007 | Crewe Alexandra | - | Tranmere Rovers | 1:1 |  |
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| 46. Spieltag | 05.05.2007 | Tranmere Rovers | - | Brentford FC | 3:1 | |
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