| 8. Spieltag | 29.10.2012 | OFI Heraklion | - | Panathinaikos | 2:2 |  |
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| 9. Spieltag | 04.11.2012 | Panathinaikos | - | AEK Athen | 1:0 | |
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| 12. Spieltag | 25.11.2012 | Platanias Chanion | - | Panathinaikos | 2:1 | ||||
| 13. Spieltag | 02.12.2012 | Panionios GSS | - | Panathinaikos | 1:2 | ||||
| 15. Spieltag | 16.12.2012 | Veria FC | - | Panathinaikos | 3:0 | ||||
| 28. Spieltag | 07.04.2013 | Panathinaikos | - | Panionios GSS | 0:0 | ||||
| 29. Spieltag | 14.04.2013 | Olympiakos Piraeus | - | Panathinaikos | 1:1 | ||||
| 30. Spieltag | 21.04.2013 | Panathinaikos | - | Veria FC | 3:2 |
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