| 1. Spieltag | 05.01.2017 | Platanias Chanion | - | Panathinaikos | 1:0 | ||||
| 2. Spieltag | 09.01.2017 | Panathinaikos | - | AO Kerkyra | 1:0 |  |
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| 11. Spieltag | 15.01.2017 | Panathinaikos | - | AEK Athen | 0:0 | |
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| 16. Spieltag | 19.01.2017 | Panathinaikos | - | Platanias Chanion | 2:1 | ||||
| 17. Spieltag | 22.01.2017 | AO Kerkyra | - | Panathinaikos | 1:1 | ||||
| 20. Spieltag | 12.02.2017 | Panathinaikos | - | Panetolikos | 4:0 | ||||
| 21. Spieltag | 18.02.2017 | Asteras Tripolis | - | Panathinaikos | 0:5 | ||||
| 22. Spieltag | 25.02.2017 | Xanthi FC | - | Panathinaikos | 1:0 | ||||
| 23. Spieltag | 04.03.2017 | Panathinaikos | - | Veria FC | 5:0 | ||||
| 24. Spieltag | 11.03.2017 | AEP Iraklis FC | - | Panathinaikos | 1:1 | |
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| 25. Spieltag | 19.03.2017 | Panathinaikos | - | Olympiakos Piraeus | 1:0 | |
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| 26. Spieltag | 02.04.2017 | AEK Athen | - | Panathinaikos | 2:3 | ||||
| 27. Spieltag | 06.04.2017 | Panathinaikos | - | Panionios GSS | 1:0 | ||||
| 29. Spieltag | 23.04.2017 | Panathinaikos | - | Atromitos | 1:0 | ||||
| 30. Spieltag | 30.04.2017 | Panathinaikos | - | AE Lárissa | 2:0 |
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