| 4. Spieltag | 03.04.2004 | Shinnik Yaroslavl | - | Alania Vladikavkaz | 1:1 | ||||
| 5. Spieltag | 07.04.2004 | Spartak Moskva | - | Shinnik Yaroslavl | 1:0 |  |
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| 6. Spieltag | 11.04.2004 | Shinnik Yaroslavl | - | Dinamo Moskva | 1:0 | ||||
| 10. Spieltag | 08.05.2004 | Shinnik Yaroslavl | - | Rubin Kazan | 1:1 | ||||
| 11. Spieltag | 15.05.2004 | Torpedo Moskva | - | Shinnik Yaroslavl | 2:0 | |
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| 13. Spieltag | 23.05.2004 | Shinnik Yaroslavl | - | FK Saturn | 1:0 | |
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| 15. Spieltag | 07.07.2004 | Shinnik Yaroslavl | - | Rotor Volgograd (1929-2005) | 2:1 | ||||
| 28. Spieltag | 30.10.2004 | Shinnik Yaroslavl | - | FK Rostov | 1:0 | ||||
| 29. Spieltag | 08.11.2004 | Kuban Krasnodar (1928-2018) | - | Shinnik Yaroslavl | 1:0 | ||||
| 30. Spieltag | 12.11.2004 | Shinnik Yaroslavl | - | Lokomotiv Moskva | 0:2 |
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