| 2. Spieltag | 30.08.1998 | AO Proodeftiki | - | Panathinaikos | 1:2 | ||||
| 11. Spieltag | 29.11.1998 | Skoda Xanthi | - | Panathinaikos | 1:0 |  |
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| 12. Spieltag | 05.12.1998 | Panathinaikos | - | Olympiakos Piraeus | 2:4 | ||||
| 13. Spieltag | 13.12.1998 | AEK Athen | - | Panathinaikos | 2:0 | ||||
| 14. Spieltag | 20.12.1998 | Panathinaikos | - | Apollon Smyrnis | 5:0 | |
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| 15. Spieltag | 16.01.1999 | Panelefsiniakos Elefsinas | - | Panathinaikos | 1:2 | ||||
| 16. Spieltag | 23.01.1999 | Veria FC | - | Panathinaikos | 0:1 | ||||
| 25. Spieltag | 03.04.1999 | Panionios GSS | - | Panathinaikos | 0:2 | ||||
| 27. Spieltag | 25.04.1999 | Iraklis Saloniki | - | Panathinaikos | 3:3 | ||||
| 32. Spieltag | 19.05.1999 | Panathinaikos | - | Panelefsiniakos Elefsinas | 2:0 | |
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| 34. Spieltag | 30.05.1999 | OFI Heraklion | - | Panathinaikos | 2:3 |
Griechenland