| 1. Spieltag | 07.08.2006 | CF Pachuca | - | Cruz Azul | 2:3 | ||||
| 2. Spieltag | 13.08.2006 | Cruz Azul | - | Atlante | 2:1 |  |
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| 3. Spieltag | 20.08.2006 | Cruz Azul | - | CF Monterrey | 2:0 |  |
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| 4. Spieltag | 27.08.2006 | Deportivo Guadalajara | - | Cruz Azul | 2:3 | ||||
| 5. Spieltag | 31.08.2006 | Cruz Azul | - | Club Necaxa | 1:2 | ||||
| 6. Spieltag | 03.09.2006 | Gallos Blancos (old) | - | Cruz Azul | 2:1 | ||||
| 7. Spieltag | 10.09.2006 | Cruz Azul | - | Pumas UNAM | 0:1 | |
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| 8. Spieltag | 14.09.2006 | UAG Tecos | - | Cruz Azul | 1:1 | |
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| 9. Spieltag | 17.09.2006 | Cruz Azul | - | CF América | 1:2 | ||||
| 10. Spieltag | 24.09.2006 | Monarcas Morelia | - | Cruz Azul | 4:4 | ||||
| 11. Spieltag | 01.10.2006 | Cruz Azul | - | Club San Luis | 0:1 | ||||
| 15. Spieltag | 29.10.2006 | Cruz Azul | - | Jaguares Chiapas | 1:0 | ||||
| 16. Spieltag | 05.11.2006 | Deportivo Toluca | - | Cruz Azul | 1:1 | |
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| 17. Spieltag | 12.11.2006 | Cruz Azul | - | Santos Laguna | 1:0 |
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