| 1. Spieltag | 19.03.2006 | Rubin Kazan | - | FK Rostov | 2:1 | ||||
| 2. Spieltag | 26.03.2006 | FK Rostov | - | FK Moskva | 4:0 |  |
|||
| 4. Spieltag | 08.04.2006 | FK Rostov | - | Torpedo Moskva | 1:1 | ||||
| 5. Spieltag | 17.04.2006 | Dinamo Moskva | - | FK Rostov | 0:1 | ||||
| 6. Spieltag | 23.04.2006 | FK Rostov | - | Shinnik Yaroslavl | 0:0 | ||||
| 7. Spieltag | 30.04.2006 | FK Tom Tomsk | - | FK Rostov | 3:1 | ||||
| 8. Spieltag | 06.05.2006 | FK Rostov | - | FK Saturn | 0:2 | ||||
| 9. Spieltag | 13.05.2006 | FK Amkar Perm | - | FK Rostov | 1:0 | ||||
| 28. Spieltag | 06.07.2006 | Spartak Nalchik | - | FK Rostov | 3:1 | |
|||
| 11. Spieltag | 16.07.2006 | FK Rostov | - | Krylia Sovetov | 2:2 | ||||
| 12. Spieltag | 23.07.2006 | Luch-Energiya Vladivostok | - | FK Rostov | 4:2 | ||||
| 13. Spieltag | 31.07.2006 | FK Rostov | - | Spartak Nalchik | 2:1 | ||||
| 14. Spieltag | 05.08.2006 | Spartak Moskva | - | FK Rostov | 5:2 | ||||
| 16. Spieltag | 20.08.2006 | FK Rostov | - | Rubin Kazan | 2:1 | ||||
| 17. Spieltag | 27.08.2006 | FK Moskva | - | FK Rostov | 4:0 | ||||
| 18. Spieltag | 10.09.2006 | FK Rostov | - | Zenit St. Petersburg | 1:3 | ||||
| 21. Spieltag | 30.09.2006 | Shinnik Yaroslavl | - | FK Rostov | 1:6 | |
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| 22. Spieltag | 15.10.2006 | FK Rostov | - | FK Tom Tomsk | 2:1 |
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