| 17. Spieltag | 14.01.2007 | AEK Athen | - | OFI Heraklion | 3:1 | ||||
| 19. Spieltag | 28.01.2007 | Olympiakos Piraeus | - | OFI Heraklion | 4:1 | ||||
| 21. Spieltag | 11.02.2007 | Panathinaikos | - | OFI Heraklion | 2:2 | ||||
| 22. Spieltag | 18.02.2007 | OFI Heraklion | - | Apollon Kalamarias | 2:0 | ||||
| 23. Spieltag | 25.02.2007 | Aris Saloniki | - | OFI Heraklion | 3:1 | ||||
| 24. Spieltag | 04.03.2007 | AE Lárissa | - | OFI Heraklion | 1:2 | ||||
| 25. Spieltag | 11.03.2007 | OFI Heraklion | - | AO Kerkyra | 3:4 | ||||
| 26. Spieltag | 17.03.2007 | AO Egaleo | - | OFI Heraklion | 1:2 | ||||
| 27. Spieltag | 15.04.2007 | OFI Heraklion | - | Ionikos Nikea | 2:1 | ||||
| 28. Spieltag | 22.04.2007 | Skoda Xanthi | - | OFI Heraklion | 4:1 | ||||
| 29. Spieltag | 29.04.2007 | OFI Heraklion | - | Panionios GSS | 3:1 |  |
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