| 16. Spieltag | 03.08.2008 | FK Amkar Perm | - | Spartak Nalchik | 0:0 | ||||
| 17. Spieltag | 10.08.2008 | Dinamo Moskva | - | FK Amkar Perm | 1:0 | ||||
| 18. Spieltag | 17.08.2008 | FK Amkar Perm | - | Spartak Moskva | 1:1 | ||||
| 19. Spieltag | 24.08.2008 | FK Moskva | - | FK Amkar Perm | 0:1 | ||||
| 20. Spieltag | 31.08.2008 | FK Amkar Perm | - | Rubin Kazan | 1:2 | ||||
| 21. Spieltag | 14.09.2008 | Shinnik Yaroslavl | - | FK Amkar Perm | 1:2 | ||||
| 22. Spieltag | 20.09.2008 | FK Amkar Perm | - | Krylia Sovetov | 1:0 | ||||
| 23. Spieltag | 28.09.2008 | FK Saturn | - | FK Amkar Perm | 0:0 | ||||
| 24. Spieltag | 05.10.2008 | FK Amkar Perm | - | Terek Grozny | 0:0 | ||||
| 25. Spieltag | 19.10.2008 | CSKA Moskva | - | FK Amkar Perm | 4:1 | ||||
| 26. Spieltag | 26.10.2008 | FK Amkar Perm | - | Lokomotiv Moskva | 0:0 | ||||
| 27. Spieltag | 02.11.2008 | Luch-Energiya Vladivostok | - | FK Amkar Perm | 0:1 | ||||
| 28. Spieltag | 09.11.2008 | FK Amkar Perm | - | Zenit St. Petersburg | 1:1 | ||||
| 29. Spieltag | 16.11.2008 | FK Tom Tomsk | - | FK Amkar Perm | 0:1 | ||||
| 30. Spieltag | 22.11.2008 | FK Amkar Perm | - | FK Khimki | 3:1 |  |
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