| 15. Spieltag | 18.12.2016 | AE Lárissa | - | Panathinaikos | 0:0 | ||||
| 2. Spieltag | 09.01.2017 | Panathinaikos | - | AO Kerkyra | 1:0 | ||||
| 11. Spieltag | 15.01.2017 | Panathinaikos | - | AEK Athen | 0:0 | ||||
| 16. Spieltag | 19.01.2017 | Panathinaikos | - | Platanias Chanion | 2:1 |  |
|||
| 17. Spieltag | 22.01.2017 | AO Kerkyra | - | Panathinaikos | 1:1 | ||||
| 28. Spieltag | 09.04.2017 | PAOK Saloniki | - | Panathinaikos | 3:0 | ||||
| 30. Spieltag | 30.04.2017 | Panathinaikos | - | AE Lárissa | 2:0 |
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