| 23. Spieltag | 30.01.2016 | Preußen Münster | - | Rot-Weiß Erfurt | 2:0 | ||||
| 24. Spieltag | 06.02.2016 | Rot-Weiß Erfurt | - | SG Sonnenhof Großaspach | 0:2 |  |
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| 25. Spieltag | 12.02.2016 | VfB Stuttgart II | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:2 | ||||
| 26. Spieltag | 21.02.2016 | Rot-Weiß Erfurt | - | Würzburger Kickers | 1:0 | ||||
| 27. Spieltag | 28.02.2016 | Erzgebirge Aue | - | Rot-Weiß Erfurt | 2:2 |  |
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| 28. Spieltag | 02.03.2016 | 1. FSV Mainz 05 II | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:0 | ||||
| 29. Spieltag | 05.03.2016 | Rot-Weiß Erfurt | - | Hallescher FC | 1:1 | |
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| 30. Spieltag | 12.03.2016 | Werder Bremen II | - | Rot-Weiß Erfurt | 0:1 | |
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| 31. Spieltag | 20.03.2016 | Rot-Weiß Erfurt | - | Chemnitzer FC | 0:2 | ||||
| 32. Spieltag | 02.04.2016 | Fortuna Köln | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:3 | |
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| 34. Spieltag | 16.04.2016 | Stuttgarter Kickers | - | Rot-Weiß Erfurt | 0:1 | ||||
| 36. Spieltag | 30.04.2016 | Hansa Rostock | - | Rot-Weiß Erfurt | 3:1 | ||||
| 37. Spieltag | 07.05.2016 | Rot-Weiß Erfurt | - | Energie Cottbus | 0:1 | ||||
| 38. Spieltag | 14.05.2016 | Holstein Kiel | - | Rot-Weiß Erfurt | 0:3 |
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