| 4. Spieltag | 19.09.2016 | Asteras Tripolis | - | PAOK Saloniki | 1:2 | ||||
| 7. Spieltag | 16.10.2016 | PAOK Saloniki | - | AEP Iraklis FC | 1:0 | ||||
| 14. Spieltag | 11.12.2016 | PAOK Saloniki | - | Platanias Chanion | 3:0 | ||||
| 15. Spieltag | 17.12.2016 | AO Kerkyra | - | PAOK Saloniki | 0:5 |  |
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| 20. Spieltag | 12.02.2017 | Xanthi FC | - | PAOK Saloniki | 0:0 | ||||
| 21. Spieltag | 19.02.2017 | PAOK Saloniki | - | Veria FC | 4:0 | ||||
| 26. Spieltag | 02.04.2017 | PAOK Saloniki | - | AE Lárissa | 2:0 |  |
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| 27. Spieltag | 05.04.2017 | Atromitos | - | PAOK Saloniki | 0:2 | ||||
| 28. Spieltag | 09.04.2017 | PAOK Saloniki | - | Panathinaikos | 3:0 | ||||
| 29. Spieltag | 23.04.2017 | Platanias Chanion | - | PAOK Saloniki | 1:3 | |
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| 30. Spieltag | 30.04.2017 | PAOK Saloniki | - | AO Kerkyra | 5:1 |
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