| 9. Spieltag | 03.09.2003 | FC Wil 1900 | - | FC Aarau | 1:0 | ||||
| 10. Spieltag | 14.09.2003 | FC Wil 1900 | - | Servette FC | 2:2 | ||||
| 11. Spieltag | 28.09.2003 | FC Thun | - | FC Wil 1900 | 3:2 | ||||
| 12. Spieltag | 02.10.2003 | FC Wil 1900 | - | Grasshopper Club Zürich | 2:1 |  |
|||
| 13. Spieltag | 05.10.2003 | FC Basel 1893 | - | FC Wil 1900 | 4:0 | ||||
| 14. Spieltag | 26.10.2003 | FC Wil 1900 | - | BSC Young Boys | 0:1 | ||||
| 15. Spieltag | 29.10.2003 | Neuchâtel Xamax FC | - | FC Wil 1900 | 0:0 | ||||
| 16. Spieltag | 02.11.2003 | FC Wil 1900 | - | FC Zürich | 2:1 | ||||
| 17. Spieltag | 23.11.2003 | FC Wil 1900 | - | FC St. Gallen | 2:0 | |
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| 27. Spieltag | 04.04.2004 | FC St. Gallen | - | FC Wil 1900 | 4:0 | ||||
| 28. Spieltag | 08.04.2004 | FC Wil 1900 | - | FC St. Gallen | 0:2 | ||||
| 35. Spieltag | 15.05.2004 | FC Wil 1900 | - | Neuchâtel Xamax FC | 3:0 |
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