| 18. Spieltag | 21.01.2007 | AE Lárissa | - | AO Kerkyra | 2:2 | ||||
| 19. Spieltag | 28.01.2007 | Atromitos | - | AO Kerkyra | 4:2 | ||||
| 20. Spieltag | 04.02.2007 | AO Kerkyra | - | AO Egaleo | 3:0 |  |
|||
| 21. Spieltag | 11.02.2007 | Ionikos Nikea | - | AO Kerkyra | 0:0 |  |
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| 22. Spieltag | 18.02.2007 | AO Kerkyra | - | Skoda Xanthi | 0:0 | ||||
| 23. Spieltag | 25.02.2007 | Panionios GSS | - | AO Kerkyra | 3:1 | ||||
| 24. Spieltag | 04.03.2007 | AO Kerkyra | - | PAOK Saloniki | 0:0 | ||||
| 25. Spieltag | 11.03.2007 | OFI Heraklion | - | AO Kerkyra | 3:4 | ||||
| 26. Spieltag | 18.03.2007 | AO Kerkyra | - | AEK Athen | 0:1 | ||||
| 27. Spieltag | 15.04.2007 | AO Kerkyra | - | Iraklis Saloniki | 0:0 | |
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| 29. Spieltag | 29.04.2007 | AO Kerkyra | - | Ergotelis | 5:1 | |
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| 30. Spieltag | 13.05.2007 | Panathinaikos | - | AO Kerkyra | 2:2 | |
Nordmazedonien