| 21. Spieltag | 27.02.2000 | Panachaiki GE | - | Skoda Xanthi | 1:1 | ||||
| 22. Spieltag | 05.03.2000 | Skoda Xanthi | - | AO Proodeftiki | 2:1 | ||||
| 23. Spieltag | 12.03.2000 | Panionios GSS | - | Skoda Xanthi | 4:0 | ||||
| 24. Spieltag | 19.03.2000 | Skoda Xanthi | - | Apollon Smyrnis | 2:0 | ||||
| 25. Spieltag | 26.03.2000 | AO Kavala | - | Skoda Xanthi | 1:0 | ||||
| 26. Spieltag | 02.04.2000 | Skoda Xanthi | - | AO Trikala | 3:0 |  |
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| 27. Spieltag | 12.04.2000 | AEK Athen | - | Skoda Xanthi | 4:1 | ||||
| 28. Spieltag | 17.04.2000 | Skoda Xanthi | - | PAOK Saloniki | 1:2 | ||||
| 29. Spieltag | 22.04.2000 | Panathinaikos | - | Skoda Xanthi | 2:1 | |
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| 30. Spieltag | 03.05.2000 | Ethnikos Asteras | - | Skoda Xanthi | 1:0 | ||||
| 31. Spieltag | 07.05.2000 | Skoda Xanthi | - | Iraklis Saloniki | 3:0 |  |
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| 32. Spieltag | 14.05.2000 | Paniliakos Pyrgos | - | Skoda Xanthi | 2:0 | |
Slowakei