| 1. Spieltag | 11.03.2000 | Yokohama F. Marinos | - | FC Tokyo | 0:1 | ||||
| 2. Spieltag | 18.03.2000 | FC Tokyo | - | Avispa Fukuoka | 2:0 |  |
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| 3. Spieltag | 25.03.2000 | FC Tokyo | - | Nagoya Grampus Eight | 2:1 n.V. | |
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| 4. Spieltag | 01.04.2000 | Kashiwa Reysol | - | FC Tokyo | 3:2 n.V. | |
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| 5. Spieltag | 05.04.2000 | FC Tokyo | - | Júbilo Iwata | 3:2 | ||||
| 6. Spieltag | 08.04.2000 | Kashima Antlers | - | FC Tokyo | 2:1 | ||||
| 7. Spieltag | 15.04.2000 | FC Tokyo | - | Gamba Osaka | 1:3 | ||||
| 8. Spieltag | 22.04.2000 | Sanfrecce Hiroshima | - | FC Tokyo | 0:1 | ||||
| 9. Spieltag | 29.04.2000 | FC Tokyo | - | Kyoto Purple Sanga | 3:0 | ||||
| 10. Spieltag | 03.05.2000 | Shimizu S-Pulse | - | FC Tokyo | 2:1 | |
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| 11. Spieltag | 06.05.2000 | FC Tokyo | - | Kawasaki Frontale | 2:1 | ||||
| 12. Spieltag | 13.05.2000 | FC Tokyo | - | Cerezo Osaka | 1:2 | ||||
| 13. Spieltag | 17.05.2000 | JEF United Ichihara | - | FC Tokyo | 1:3 | ||||
| 14. Spieltag | 20.05.2000 | FC Tokyo | - | Vissel Kobe | 1:2 | ||||
| 15. Spieltag | 27.05.2000 | Verdy Kawasaki | - | FC Tokyo | 3:0 |
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