| 22. Spieltag | 16.01.2000 | Levante UD | - | CD Logroñés | 1:0 | ||||
| 23. Spieltag | 23.01.2000 | CD Logroñés | - | CD Tenerife | 0:0 | ||||
| 24. Spieltag | 30.01.2000 | Sporting Gijón | - | CD Logroñés | 1:4 |  |
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| 25. Spieltag | 06.02.2000 | CD Logroñés | - | Recreativo Huelva | 0:3 | ||||
| 26. Spieltag | 13.02.2000 | CD Toledo | - | CD Logroñés | 2:1 | ||||
| 35. Spieltag | 15.04.2000 | UE Lleida | - | CD Logroñés | 1:0 | |
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| 36. Spieltag | 23.04.2000 | CD Logroñés | - | UD Salamanca | 0:0 | ||||
| 37. Spieltag | 30.04.2000 | Albacete | - | CD Logroñés | 2:2 |  |
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| 38. Spieltag | 07.05.2000 | CD Logroñés | - | CD Badajoz | 2:0 | |
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| 40. Spieltag | 21.05.2000 | CD Logroñés | - | SD Eibar | 0:1 | ||||
| 41. Spieltag | 28.05.2000 | Elche CF | - | CD Logroñés | 2:1 | ||||
| 42. Spieltag | 04.06.2000 | CD Logroñés | - | Villarreal CF | 1:0 | |
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