| 4. Spieltag | 17.09.2006 | OFI Heraklion | - | Olympiakos Piraeus | 1:2 | ||||
| 5. Spieltag | 23.09.2006 | Ergotelis | - | OFI Heraklion | 2:0 | ||||
| 6. Spieltag | 01.10.2006 | OFI Heraklion | - | Panathinaikos | 3:3 | ||||
| 7. Spieltag | 22.10.2006 | Apollon Kalamarias | - | OFI Heraklion | 0:0 | ||||
| 17. Spieltag | 14.01.2007 | AEK Athen | - | OFI Heraklion | 3:1 | ||||
| 18. Spieltag | 21.01.2007 | OFI Heraklion | - | Iraklis Saloniki | 1:0 |  |
|||
| 19. Spieltag | 28.01.2007 | Olympiakos Piraeus | - | OFI Heraklion | 4:1 |  |
|||
| 20. Spieltag | 04.02.2007 | OFI Heraklion | - | Ergotelis | 1:3 | ||||
| 21. Spieltag | 11.02.2007 | Panathinaikos | - | OFI Heraklion | 2:2 | ||||
| 22. Spieltag | 18.02.2007 | OFI Heraklion | - | Apollon Kalamarias | 2:0 | |
|||
| 23. Spieltag | 25.02.2007 | Aris Saloniki | - | OFI Heraklion | 3:1 | ||||
| 24. Spieltag | 04.03.2007 | AE Lárissa | - | OFI Heraklion | 1:2 | ||||
| 25. Spieltag | 11.03.2007 | OFI Heraklion | - | AO Kerkyra | 3:4 | ||||
| 26. Spieltag | 17.03.2007 | AO Egaleo | - | OFI Heraklion | 1:2 | ||||
| 27. Spieltag | 15.04.2007 | OFI Heraklion | - | Ionikos Nikea | 2:1 | |
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