# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 7 5 1 1 11:4 7 16
2 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 7 4 1 2 9:5 4 13
3 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 7 3 2 2 8:8 0 11
4 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 7 3 1 3 6:3 3 10
5 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 7 3 1 3 11:9 2 10
6 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 7 2 4 1 5:6 -1 10
7 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 7 2 2 3 7:7 0 8
8 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 7 2 0 4 7:9 -2 6
9 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 7 1 2 3 2:6 -4 5
10 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 7 1 2 4 2:11 -9 5
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.