# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 8 5 2 1 16:9 7 17
2 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 8 5 0 3 15:8 7 15
3 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 8 4 1 3 17:12 5 13
4 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 8 3 3 2 14:13 1 12
5 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 8 3 3 2 7:8 -1 12
6 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 8 4 0 4 14:16 -2 12
7 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 8 3 1 4 16:15 1 10
8 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 8 2 2 4 5:11 -6 8
9 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 8 3 1 4 12:12 0 3
10 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 8 0 3 5 4:16 -12 3
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.