# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 18 13 2 3 39:15 24 41
2 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 18 10 6 2 38:18 20 36
3 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 18 10 2 6 29:21 8 32
4 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 18 8 3 7 25:28 -3 27
5 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 18 7 2 9 27:27 0 23
6 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 18 6 5 7 24:26 -2 23
7 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 18 5 6 7 22:32 -10 21
8 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 18 5 4 9 22:34 -12 19
9 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 18 4 4 10 23:36 -13 16
10 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 18 3 4 11 17:29 -12 13
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.