# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 9 6 2 1 20:10 10 20
2 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 9 5 0 4 17:11 6 15
3 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 9 5 0 4 17:18 -1 15
4 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 9 4 2 3 17:12 5 14
5 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 9 3 4 2 7:8 -1 13
6 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 9 3 3 3 15:17 -2 12
7 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 9 3 2 4 16:15 1 11
8 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 9 2 2 5 5:12 -7 8
9 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 9 1 3 5 5:16 -11 6
10 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 9 3 2 4 12:12 0 4
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.