# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 9 6 1 2 13:7 6 19
2 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 9 5 2 2 12:6 6 17
3 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 9 4 1 4 8:6 2 13
4 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 9 3 3 3 8:9 -1 12
5 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 9 2 6 1 5:6 -1 12
6 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 9 4 0 4 13:11 2 12
7 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 9 3 2 4 12:12 0 11
8 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 9 2 3 4 8:9 -1 9
9 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 9 1 4 3 2:6 -4 7
10 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 9 1 4 4 2:11 -9 7
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.