| Champions League Qual. | Sp. | S | U | N | Tore | |||
| Zu Hause | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | : | 5 | |
| Auswärts | 1 | 0 | 0 | 1 | 1 | : | 2 | |
| ∑ | 2 | 0 | 0 | 2 | 1 | : | 7 | |
| GESAMT | Sp. | S | U | N | Tore | |||
| Zu Hause | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | : | 5 | |
| Auswärts | 1 | 0 | 0 | 1 | 1 | : | 2 | |
| Neutraler Ort | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | : | 0 | |
| ∑ | 2 | 0 | 0 | 2 | 1 | : | 7 | |
| Champions League Qual. | |||||
| 2024/2025 | 1. Runde | NK Celje | - | FC Flora | 2:1 (0:1) |
| 2024/2025 | 1. Runde | FC Flora | - | NK Celje | 0:5 (0:3) |
|
Für Spiele, die im Elfmeterschießen entschieden wurden, geht der Spielstand nach 120 Minuten in diese Wertung ein. |
Estland 
![FC Flora [Frauen]](https://s.hs-data.com/bilder/wappen/mini/30430.gif?fallback=png "FC Flora [Frauen]"){kind=small}
![FC Flora [A-Junioren]](https://s.hs-data.com/bilder/wappen/mini/24240.gif?fallback=png "FC Flora [A-Junioren]"){kind=small}