| 16. Spieltag | 15.07.2007 | FK Tom Tomsk | - | FK Moskva | 1:2 | ||||
| 17. Spieltag | 21.07.2007 | FK Saturn | - | FK Tom Tomsk | 0:0 |  |
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| 18. Spieltag | 29.07.2007 | FK Tom Tomsk | - | FK Rostov | 1:1 | ||||
| 19. Spieltag | 05.08.2007 | Spartak Moskva | - | FK Tom Tomsk | 3:2 | |
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| 22. Spieltag | 25.08.2007 | FK Tom Tomsk | - | Luch-Energiya Vladivostok | 3:1 |  |
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| 23. Spieltag | 31.08.2007 | Dinamo Moskva | - | FK Tom Tomsk | 3:1 | ||||
| 24. Spieltag | 23.09.2007 | Krylia Sovetov | - | FK Tom Tomsk | 1:1 | |
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| 25. Spieltag | 30.09.2007 | FK Tom Tomsk | - | Kuban Krasnodar (1928-2018) | 2:0 | ||||
| 26. Spieltag | 07.10.2007 | Rubin Kazan | - | FK Tom Tomsk | 1:3 | ||||
| 27. Spieltag | 20.10.2007 | FK Tom Tomsk | - | CSKA Moskva | 0:1 | ||||
| 28. Spieltag | 28.10.2007 | Lokomotiv Moskva | - | FK Tom Tomsk | 0:0 | ||||
| 29. Spieltag | 03.11.2007 | FK Tom Tomsk | - | FK Khimki | 3:1 |
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