| 23. Spieltag | 28.01.2012 | Wacker Burghausen | - | Werder Bremen II | 3:1 | ||||
| 24. Spieltag | 05.02.2012 | Werder Bremen II | - | 1. FC Saarbrücken | 2:2 | ||||
| 25. Spieltag | 10.02.2012 | Preußen Münster | - | Werder Bremen II | 0:0 | ||||
| 27. Spieltag | 25.02.2012 | Kickers Offenbach | - | Werder Bremen II | 3:0 | ||||
| 28. Spieltag | 03.03.2012 | Werder Bremen II | - | SpVgg Unterhaching | 1:1 | ||||
| 29. Spieltag | 11.03.2012 | Chemnitzer FC | - | Werder Bremen II | 2:0 | ||||
| 32. Spieltag | 01.04.2012 | Werder Bremen II | - | SV Babelsberg 03 | 1:2 | ||||
| 33. Spieltag | 07.04.2012 | SV Sandhausen | - | Werder Bremen II | 2:0 | ||||
| 34. Spieltag | 11.04.2012 | VfB Stuttgart II | - | Werder Bremen II | 1:0 | ||||
| 35. Spieltag | 14.04.2012 | Werder Bremen II | - | VfL Osnabrück | 0:2 | ||||
| 37. Spieltag | 28.04.2012 | Werder Bremen II | - | SV Darmstadt 98 | 0:4 |
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