| 2. Spieltag | 23.07.2008 | FC Basel 1893 | - | Grasshopper Club Zürich | 1:0 | ||||
| 4. Spieltag | 02.08.2008 | FC Sion | - | FC Basel 1893 | 2:0 |  |
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| 5. Spieltag | 09.08.2008 | FC Basel 1893 | - | FC Vaduz | 4:0 |  |
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| 6. Spieltag | 17.08.2008 | FC Zürich | - | FC Basel 1893 | 1:4 | ||||
| 7. Spieltag | 23.08.2008 | FC Basel 1893 | - | Neuchâtel Xamax FC | 4:3 | ||||
| 8. Spieltag | 30.08.2008 | FC Aarau | - | FC Basel 1893 | 0:2 | |
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| 9. Spieltag | 13.09.2008 | FC Basel 1893 | - | FC Luzern | 2:0 | ||||
| 10. Spieltag | 27.09.2008 | FC Basel 1893 | - | BSC Young Boys | 1:2 | ||||
| 11. Spieltag | 05.10.2008 | Grasshopper Club Zürich | - | FC Basel 1893 | 1:1 | |
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| 32. Spieltag | 09.05.2009 | FC Aarau | - | FC Basel 1893 | 3:1 |
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