| 1. Spieltag | 27.08.2012 | Panionios GSS | - | Aris Saloniki | 1:0 |  |
|||
| 2. Spieltag | 01.09.2012 | Veria FC | - | Panionios GSS | 0:1 | ||||
| 3. Spieltag | 17.09.2012 | Panionios GSS | - | OFI Heraklion | 2:1 | ||||
| 4. Spieltag | 22.09.2012 | Levadiakos | - | Panionios GSS | 3:0 | ||||
| 5. Spieltag | 29.09.2012 | Panionios GSS | - | AEK Athen | 1:0 | |
|||
| 12. Spieltag | 25.11.2012 | Asteras Tripolis | - | Panionios GSS | 2:1 | ||||
| 13. Spieltag | 02.12.2012 | Panionios GSS | - | Panathinaikos | 1:2 | ||||
| 15. Spieltag | 15.12.2012 | Panionios GSS | - | Olympiakos Piraeus | 1:2 |  |
|||
| 23. Spieltag | 24.02.2013 | Panionios GSS | - | Panthrakikos | 2:0 | ||||
| 24. Spieltag | 03.03.2013 | PAOK Saloniki | - | Panionios GSS | 4:2 | ||||
| 28. Spieltag | 07.04.2013 | Panathinaikos | - | Panionios GSS | 0:0 | ||||
| 29. Spieltag | 14.04.2013 | Panionios GSS | - | Skoda Xanthi | 3:3 |  |
|
||
| 30. Spieltag | 21.04.2013 | Olympiakos Piraeus | - | Panionios GSS | 2:1 |
Griechenland