| 14. Spieltag | 06.08.2006 | Zenit St. Petersburg | - | Shinnik Yaroslavl | 1:0 |  |
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| 15. Spieltag | 12.08.2006 | FK Tom Tomsk | - | Zenit St. Petersburg | 2:2 | |
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| 16. Spieltag | 20.08.2006 | FK Saturn | - | Zenit St. Petersburg | 0:0 | ||||
| 17. Spieltag | 28.08.2006 | Zenit St. Petersburg | - | FK Amkar Perm | 2:0 | |
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| 18. Spieltag | 10.09.2006 | FK Rostov | - | Zenit St. Petersburg | 1:3 | |
|||
| 19. Spieltag | 17.09.2006 | Zenit St. Petersburg | - | Krylia Sovetov | 1:0 | ||||
| 21. Spieltag | 01.10.2006 | Zenit St. Petersburg | - | Spartak Nalchik | 4:0 |  |
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| 22. Spieltag | 14.10.2006 | Spartak Moskva | - | Zenit St. Petersburg | 1:0 | ||||
| 23. Spieltag | 22.10.2006 | Zenit St. Petersburg | - | Lokomotiv Moskva | 4:1 | ||||
| 24. Spieltag | 25.10.2006 | Rubin Kazan | - | Zenit St. Petersburg | 3:0 | ||||
| 25. Spieltag | 29.10.2006 | Zenit St. Petersburg | - | FK Moskva | 1:1 | |
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| 26. Spieltag | 05.11.2006 | CSKA Moskva | - | Zenit St. Petersburg | 1:0 | |
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| 27. Spieltag | 08.11.2006 | Torpedo Moskva | - | Zenit St. Petersburg | 1:2 | ||||
| 29. Spieltag | 18.11.2006 | Shinnik Yaroslavl | - | Zenit St. Petersburg | 1:2 | ||||
| 30. Spieltag | 26.11.2006 | Zenit St. Petersburg | - | FK Tom Tomsk | 0:0 |
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