| 14. Spieltag | 22.11.2008 | Energie Cottbus II | - | Hansa Rostock II | 1:8 | ||||
| 15. Spieltag | 29.11.2008 | Hansa Rostock II | - | Hamburger SV II | 3:0 | ||||
| 17. Spieltag | 14.12.2008 | Hertha BSC II | - | Hansa Rostock II | 2:0 | ||||
| 21. Spieltag | 07.03.2009 | Hansa Rostock II | - | VFC Plauen | 2:0 | ||||
| 24. Spieltag | 28.03.2009 | Hannover 96 II | - | Hansa Rostock II | 1:1 |
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