# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Holstein Kiel, Deutschland Holstein Kiel 15 10 3 2 24:12 12 33
2 SV Babelsberg 03, Deutschland SV Babelsberg 03 15 9 5 1 19:7 12 32
3 Hallescher FC, Deutschland Hallescher FC 15 8 7 0 17:8 9 31
4 1. FC Magdeburg, Deutschland 1. FC Magdeburg 15 9 3 3 21:10 11 30
5 SV Wilhelmshaven, Deutschland SV Wilhelmshaven 15 7 5 3 24:17 7 26
6 Hannover 96 II, Deutschland Hannover 96 II 15 7 2 6 23:19 4 23
7 VfL Wolfsburg II, Deutschland VfL Wolfsburg II 15 6 3 6 20:15 5 21
8 FC Oberneuland, Deutschland FC Oberneuland 15 6 3 6 16:16 0 21
9 Hansa Rostock II, Deutschland Hansa Rostock II 15 6 2 7 28:25 3 20
10 VFC Plauen, Deutschland VFC Plauen 15 5 5 5 22:22 0 20
11 Chemnitzer FC, Deutschland Chemnitzer FC 15 5 4 6 23:18 5 19
12 Altona 93, Deutschland Altona 93 15 5 4 6 22:25 -3 19
13 VfB Lübeck, Deutschland VfB Lübeck 15 4 6 5 17:16 1 18
14 Hamburger SV II, Deutschland Hamburger SV II 15 4 4 7 16:19 -3 16
15 Türkiyemspor Berlin, Deutschland Türkiyemspor Berlin 15 4 2 9 13:24 -11 14
16 Hertha BSC II, Deutschland Hertha BSC II 15 3 3 9 13:30 -17 12
17 Sachsen Leipzig, Deutschland Sachsen Leipzig 15 2 4 9 7:21 -14 10
18 Energie Cottbus II, Deutschland Energie Cottbus II 15 1 3 11 10:31 -21 6
  Aufstieg
  Abstieg

# Sachsen Leipzig hat am 4. März 2009 einen Insolvenzantrag gestellt. Der Verein steht damit als erster Absteiger aus der Regionalliga Nord fest.

# Altona 93 erhält keine Lizenz für die Saison 2009/2010 und steht damit als Absteiger fest.

# Türkiyemspor Berlin hält trotz Rang 15 die Klasse, da Kickes Emden nach dem Lizenzrückzug für die 3. Liga in der Saison 2009/2010 in der Oberliga startet.