| 1. Runde | 16.09.1987 | Panathinaikos | - | AJ Auxerre | 2:0 | ||||
| 1. Runde | 30.09.1987 | AJ Auxerre | - | Panathinaikos | 3:2 | ||||
| 2. Runde | 21.10.1987 | Panathinaikos | - | Juventus | 1:0 | ||||
| 2. Runde | 04.11.1987 | Juventus | - | Panathinaikos | 3:2 | ||||
| Achtelfinale | 25.11.1987 | Budapest Honved SE | - | Panathinaikos | 5:2 | ||||
| Achtelfinale | 09.12.1987 | Panathinaikos | - | Budapest Honved SE | 5:1 |  |
|||
| Viertelfinale | 02.03.1988 | Panathinaikos | - | Club Brugge KV | 2:2 | ||||
| Viertelfinale | 16.03.1988 | Club Brugge KV | - | Panathinaikos | 1:0 |
Griechenland