| 16. Spieltag | 07.01.2007 | Panionios GSS | - | Iraklis Saloniki | 2:1 | ||||
| 17. Spieltag | 14.01.2007 | Olympiakos Piraeus | - | Panionios GSS | 1:0 | ||||
| 18. Spieltag | 21.01.2007 | Panionios GSS | - | Ergotelis | 2:0 |  |
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| 19. Spieltag | 27.01.2007 | Panathinaikos | - | Panionios GSS | 2:0 | ||||
| 20. Spieltag | 04.02.2007 | Panionios GSS | - | Apollon Kalamarias | 3:1 | |
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| 21. Spieltag | 10.02.2007 | Panionios GSS | - | Aris Saloniki | 0:0 | ||||
| 23. Spieltag | 25.02.2007 | Panionios GSS | - | AO Kerkyra | 3:1 | ||||
| 24. Spieltag | 04.03.2007 | AO Egaleo | - | Panionios GSS | 0:2 | ||||
| 25. Spieltag | 11.03.2007 | Panionios GSS | - | Ionikos Nikea | 2:0 | |
|||
| 26. Spieltag | 18.03.2007 | Skoda Xanthi | - | Panionios GSS | 1:1 | ||||
| 27. Spieltag | 15.04.2007 | Atromitos | - | Panionios GSS | 0:1 | ||||
| 28. Spieltag | 22.04.2007 | Panionios GSS | - | PAOK Saloniki | 3:1 | ||||
| 29. Spieltag | 29.04.2007 | OFI Heraklion | - | Panionios GSS | 3:1 | ||||
| 30. Spieltag | 13.05.2007 | Panionios GSS | - | AEK Athen | 3:1 | |
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