| 3. Spieltag | 09.03.2025 | Real Salt Lake | - | San Diego FC | 1:3 | ||||
| 4. Spieltag | 16.03.2025 | San Diego FC | - | Columbus Crew | 1:1 | ||||
| 5. Spieltag | 23.03.2025 | Austin FC | - | San Diego FC | 2:1 | ||||
| 10. Spieltag | 27.04.2025 | San Diego FC | - | Real Salt Lake | 1:3 |  |
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| 11. Spieltag | 04.05.2025 | San Diego FC | - | FC Dallas | 5:0 | ||||
| 12. Spieltag | 11.05.2025 | St. Louis City SC | - | San Diego FC | 1:2 | ||||
| 13. Spieltag | 15.05.2025 | San Diego FC | - | Colorado Rapids | 2:0 | ||||
| 14. Spieltag | 18.05.2025 | San Diego FC | - | Sporting Kansas City | 0:0 | |
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| 15. Spieltag | 24.05.2025 | San Diego FC | - | Los Angeles Galaxy | 2:1 | ||||
| 16. Spieltag | 29.05.2025 | Seattle Sounders | - | San Diego FC | 1:0 | ||||
| 17. Spieltag | 01.06.2025 | San Diego FC | - | Austin FC | 2:0 | ||||
| 18. Spieltag | 15.06.2025 | Minnesota United FC | - | San Diego FC | 2:4 | ||||
| 19. Spieltag | 26.06.2025 | Vancouver Whitecaps | - | San Diego FC | 3:5 | ||||
| 20. Spieltag | 29.06.2025 | FC Dallas | - | San Diego FC | 2:3 | ||||
| 21. Spieltag | 06.07.2025 | San Diego FC | - | Houston Dynamo | 3:4 |  |
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