| 1. Spieltag | 20.07.2019 | Würzburger Kickers | - | Bayern München II | 3:1 | ||||
| 2. Spieltag | 26.07.2019 | Bayern München II | - | KFC Uerdingen 05 | 2:1 | ||||
| 4. Spieltag | 03.08.2019 | Bayern München II | - | Viktoria Köln | 2:5 | ||||
| 6. Spieltag | 24.08.2019 | Bayern München II | - | Chemnitzer FC | 2:2 | ||||
| 7. Spieltag | 31.08.2019 | Bayern München II | - | SpVgg Unterhaching | 1:2 | ||||
| 8. Spieltag | 14.09.2019 | SG Sonnenhof Großaspach | - | Bayern München II | 2:2 |  |
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| 9. Spieltag | 22.09.2019 | Bayern München II | - | FC Ingolstadt 04 | 2:1 | |
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| 10. Spieltag | 28.09.2019 | Preußen Münster | - | Bayern München II | 1:4 | ||||
| 11. Spieltag | 06.10.2019 | Bayern München II | - | Eintracht Braunschweig | 2:0 | ||||
| 12. Spieltag | 20.10.2019 | FSV Zwickau | - | Bayern München II | 3:0 | ||||
| 13. Spieltag | 28.10.2019 | Bayern München II | - | Waldhof Mannheim | 2:2 | ||||
| 19. Spieltag | 14.12.2019 | Bayern München II | - | 1. FC Kaiserslautern | 1:3 | ||||
| 20. Spieltag | 22.12.2019 | Bayern München II | - | Würzburger Kickers | 1:1 |
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