| 2. Spieltag | 23.07.2008 | FC Zürich | - | FC Luzern | 1:0 | ||||
| 8. Spieltag | 01.09.2008 | FC Zürich | - | AC Bellinzona | 3:0 | ||||
| 9. Spieltag | 14.09.2008 | FC Vaduz | - | FC Zürich | 1:7 | ||||
| 10. Spieltag | 28.09.2008 | FC Zürich | - | Neuchâtel Xamax FC | 3:0 | ||||
| 11. Spieltag | 06.10.2008 | FC Luzern | - | FC Zürich | 0:3 | ||||
| 12. Spieltag | 25.10.2008 | FC Zürich | - | FC Aarau | 4:0 | ||||
| 14. Spieltag | 09.11.2008 | FC Zürich | - | Grasshopper Club Zürich | 2:1 | ||||
| 16. Spieltag | 29.11.2008 | FC Zürich | - | FC Sion | 1:0 | ||||
| 17. Spieltag | 06.12.2008 | AC Bellinzona | - | FC Zürich | 0:3 | ||||
| 18. Spieltag | 14.12.2008 | FC Zürich | - | FC Vaduz | 1:0 | ||||
| 29. Spieltag | 22.04.2009 | FC Aarau | - | FC Zürich | 0:3 | ||||
| 30. Spieltag | 26.04.2009 | FC Zürich | - | BSC Young Boys | 3:0 | ||||
| 33. Spieltag | 12.05.2009 | FC Vaduz | - | FC Zürich | 3:5 |
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