| 1. Spieltag | 16.08.2008 | SV Zulte Waregem | - | Sporting Lokeren | 0:0 |  |
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| 5. Spieltag | 20.09.2008 | FCV Dender EH | - | SV Zulte Waregem | 2:0 | ||||
| 6. Spieltag | 27.09.2008 | SV Zulte Waregem | - | AFC Tubize | 1:0 | ||||
| 7. Spieltag | 04.10.2008 | KVC Westerlo | - | SV Zulte Waregem | 3:2 |  |
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| 8. Spieltag | 19.10.2008 | SV Zulte Waregem | - | RSC Anderlecht | 4:0 | |
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| 9. Spieltag | 25.10.2008 | KSV Roeselare | - | SV Zulte Waregem | 0:3 | |
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| 2. Spieltag | 29.10.2008 | Club Brugge KV | - | SV Zulte Waregem | 2:0 | |
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| 10. Spieltag | 02.11.2008 | SV Zulte Waregem | - | KAA Gent | 0:2 | ||||
| 11. Spieltag | 07.11.2008 | Cercle Brugge | - | SV Zulte Waregem | 2:0 | |
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| 14. Spieltag | 29.11.2008 | SV Zulte Waregem | - | Sporting Charleroi | 4:2 | |
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| 15. Spieltag | 06.12.2008 | Standard Liège | - | SV Zulte Waregem | 1:2 | ||||
| 13. Spieltag | 16.12.2008 | KV Kortrijk | - | SV Zulte Waregem | 1:0 | |
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| 17. Spieltag | 20.12.2008 | RAEC Mons | - | SV Zulte Waregem | 2:2 | ||||
| 18. Spieltag | 17.01.2009 | Sporting Lokeren | - | SV Zulte Waregem | 2:1 | |
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| 19. Spieltag | 25.01.2009 | SV Zulte Waregem | - | Club Brugge KV | 3:1 | |
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| 20. Spieltag | 31.01.2009 | SV Zulte Waregem | - | KV Mechelen | 1:1 | |
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