| 28. Spieltag | 06.07.2006 | Spartak Nalchik | - | FK Rostov | 3:1 | ||||
| 10. Spieltag | 10.07.2006 | CSKA Moskva | - | FK Rostov | 1:2 | ||||
| 11. Spieltag | 16.07.2006 | FK Rostov | - | Krylia Sovetov | 2:2 | ||||
| 12. Spieltag | 23.07.2006 | Luch-Energiya Vladivostok | - | FK Rostov | 4:2 |  |
|||
| 13. Spieltag | 31.07.2006 | FK Rostov | - | Spartak Nalchik | 2:1 | ||||
| 18. Spieltag | 10.09.2006 | FK Rostov | - | Zenit St. Petersburg | 1:3 | ||||
| 19. Spieltag | 16.09.2006 | Torpedo Moskva | - | FK Rostov | 0:2 | ||||
| 20. Spieltag | 23.09.2006 | FK Rostov | - | Dinamo Moskva | 2:1 | ||||
| 21. Spieltag | 30.09.2006 | Shinnik Yaroslavl | - | FK Rostov | 1:6 | ||||
| 22. Spieltag | 15.10.2006 | FK Rostov | - | FK Tom Tomsk | 2:1 | ||||
| 23. Spieltag | 21.10.2006 | FK Saturn | - | FK Rostov | 0:0 | |
|||
| 24. Spieltag | 25.10.2006 | FK Rostov | - | FK Amkar Perm | 1:1 | ||||
| 25. Spieltag | 28.10.2006 | FK Rostov | - | CSKA Moskva | 1:2 | |
|||
| 27. Spieltag | 08.11.2006 | FK Rostov | - | Luch-Energiya Vladivostok | 1:0 | ||||
| 29. Spieltag | 18.11.2006 | FK Rostov | - | Spartak Moskva | 3:4 | ||||
| 30. Spieltag | 26.11.2006 | Lokomotiv Moskva | - | FK Rostov | 1:0 |
Serbien