| 9. Spieltag | 22.09.2012 | Dinamo Moskva | - | FK Amkar Perm | 3:2 |  |
|||
| 10. Spieltag | 29.09.2012 | FK Amkar Perm | - | Spartak Moskva | 1:3 | |
|||
| 11. Spieltag | 07.10.2012 | Rubin Kazan | - | FK Amkar Perm | 0:1 | ||||
| 12. Spieltag | 21.10.2012 | FK Amkar Perm | - | Terek Grozny | 0:1 | ||||
| 13. Spieltag | 26.10.2012 | Lokomotiv Moskva | - | FK Amkar Perm | 1:2 | ||||
| 15. Spieltag | 09.11.2012 | FK Rostov | - | FK Amkar Perm | 3:0 | ||||
| 16. Spieltag | 18.11.2012 | CSKA Moskva | - | FK Amkar Perm | 3:0 | ||||
| 17. Spieltag | 26.11.2012 | FK Amkar Perm | - | Anzhi Makhachkala | 1:2 | ||||
| 18. Spieltag | 03.12.2012 | Mordovia Saransk | - | FK Amkar Perm | 1:1 | ||||
| 20. Spieltag | 08.03.2013 | FK Krasnodar | - | FK Amkar Perm | 2:1 | ||||
| 21. Spieltag | 16.03.2013 | FK Amkar Perm | - | Spartak Vladikavkaz | 5:1 | ||||
| 28. Spieltag | 11.05.2013 | Kuban Krasnodar (1928-2018) | - | FK Amkar Perm | 4:0 |
Montenegro