| 6. Spieltag | 18.09.1999 | KRC Genk | - | Excelsior Mouscron | 2:2 | ||||
| 19. Spieltag | 15.01.2000 | Excelsior Mouscron | - | KRC Harelbeke | 4:2 | ||||
| 20. Spieltag | 22.01.2000 | KV Mechelen | - | Excelsior Mouscron | 1:3 | ||||
| 22. Spieltag | 05.02.2000 | KAA Gent | - | Excelsior Mouscron | 2:3 | ||||
| 23. Spieltag | 11.02.2000 | Excelsior Mouscron | - | KRC Genk | 5:0 | ||||
| 26. Spieltag | 11.03.2000 | Excelsior Mouscron | - | Verbroedering Geel | 3:1 | ||||
| 27. Spieltag | 19.03.2000 | KSK Beveren | - | Excelsior Mouscron | 1:1 |  |
|||
| 28. Spieltag | 25.03.2000 | Excelsior Mouscron | - | Lierse SK (old) | 3:3 | ||||
| 29. Spieltag | 01.04.2000 | Lommelse SK | - | Excelsior Mouscron | 0:4 | ||||
| 30. Spieltag | 07.04.2000 | Excelsior Mouscron | - | Club Brugge KV | 1:2 | ||||
| 31. Spieltag | 15.04.2000 | Sint-Truidense VV | - | Excelsior Mouscron | 0:0 | ||||
| 32. Spieltag | 22.04.2000 | Excelsior Mouscron | - | Sporting Lokeren | 0:0 | ||||
| 33. Spieltag | 06.05.2000 | Germinal Beerschot | - | Excelsior Mouscron | 0:1 | ||||
| 34. Spieltag | 11.05.2000 | Excelsior Mouscron | - | K.S.C. Eendracht Aalst | 1:1 |
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