| 2. Spieltag | 20.03.2005 | FK Tom Tomsk | - | CSKA Moskva | 0:0 | ||||
| 3. Spieltag | 03.04.2005 | Krylia Sovetov | - | FK Tom Tomsk | 1:1 | ||||
| 4. Spieltag | 10.04.2005 | FK Tom Tomsk | - | Zenit St. Petersburg | 2:0 | ||||
| 5. Spieltag | 16.04.2005 | Torpedo Moskva | - | FK Tom Tomsk | 3:0 | ||||
| 6. Spieltag | 23.04.2005 | FK Tom Tomsk | - | Shinnik Yaroslavl | 0:0 | ||||
| 7. Spieltag | 30.04.2005 | FK Saturn | - | FK Tom Tomsk | 0:2 | ||||
| 8. Spieltag | 15.05.2005 | FK Tom Tomsk | - | Spartak Moskva | 0:1 | ||||
| 9. Spieltag | 21.05.2005 | FK Moskva | - | FK Tom Tomsk | 4:1 | ||||
| 10. Spieltag | 28.05.2005 | FK Tom Tomsk | - | Rubin Kazan | 1:2 | ||||
| 12. Spieltag | 18.06.2005 | FK Tom Tomsk | - | FK Rostov | 1:2 | ||||
| 20. Spieltag | 21.08.2005 | FK Tom Tomsk | - | Torpedo Moskva | 1:1 | ||||
| 21. Spieltag | 27.08.2005 | Shinnik Yaroslavl | - | FK Tom Tomsk | 0:0 | ||||
| 22. Spieltag | 11.09.2005 | FK Tom Tomsk | - | FK Saturn | 0:3 | ||||
| 28. Spieltag | 30.10.2005 | FK Tom Tomsk | - | Dinamo Moskva | 3:2 | ||||
| 29. Spieltag | 06.11.2005 | Alania Vladikavkaz | - | FK Tom Tomsk | 1:2 | ||||
| 30. Spieltag | 19.11.2005 | FK Tom Tomsk | - | Terek Grozny | 2:0 |
Estland