| 1. Spieltag | 27.08.2012 | Panionios GSS | - | Aris Saloniki | 1:0 |  |
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| 2. Spieltag | 01.09.2012 | Veria FC | - | Panionios GSS | 0:1 | ||||
| 3. Spieltag | 17.09.2012 | Panionios GSS | - | OFI Heraklion | 2:1 | ||||
| 4. Spieltag | 22.09.2012 | Levadiakos | - | Panionios GSS | 3:0 | ||||
| 5. Spieltag | 29.09.2012 | Panionios GSS | - | AEK Athen | 1:0 | |
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| 6. Spieltag | 07.10.2012 | PAS Giannina | - | Panionios GSS | 1:2 | ||||
| 7. Spieltag | 20.10.2012 | Panionios GSS | - | AO Kerkyra | 0:1 | ||||
| 8. Spieltag | 27.10.2012 | Panthrakikos | - | Panionios GSS | 1:2 | ||||
| 9. Spieltag | 04.11.2012 | Panionios GSS | - | PAOK Saloniki | 1:2 | ||||
| 10. Spieltag | 11.11.2012 | Atromitos | - | Panionios GSS | 1:0 | ||||
| 11. Spieltag | 17.11.2012 | Panionios GSS | - | Platanias Chanion | 4:0 | ||||
| 12. Spieltag | 25.11.2012 | Asteras Tripolis | - | Panionios GSS | 2:1 | ||||
| 13. Spieltag | 02.12.2012 | Panionios GSS | - | Panathinaikos | 1:2 | ||||
| 15. Spieltag | 15.12.2012 | Panionios GSS | - | Olympiakos Piraeus | 1:2 |
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