| 1. Spieltag | 17.08.2008 | KRC Genk | - | Germinal Beerschot | 1:1 |  |
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| 2. Spieltag | 24.08.2008 | RAEC Mons | - | KRC Genk | 3:1 | ||||
| 3. Spieltag | 30.08.2008 | KRC Genk | - | Sporting Lokeren | 1:0 | ||||
| 4. Spieltag | 14.09.2008 | SV Zulte Waregem | - | KRC Genk | 1:3 | ||||
| 5. Spieltag | 21.09.2008 | KRC Genk | - | Club Brugge KV | 0:1 | |
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| 6. Spieltag | 28.09.2008 | Excelsior Mouscron | - | KRC Genk | 1:2 | ||||
| 7. Spieltag | 04.10.2008 | KRC Genk | - | KV Mechelen | 2:1 | ||||
| 8. Spieltag | 18.10.2008 | FCV Dender EH | - | KRC Genk | 2:4 | ||||
| 9. Spieltag | 26.10.2008 | KRC Genk | - | Standard Liège | 0:0 | ||||
| 10. Spieltag | 01.11.2008 | AFC Tubize | - | KRC Genk | 1:3 | ||||
| 11. Spieltag | 08.11.2008 | KVC Westerlo | - | KRC Genk | 1:0 | ||||
| 13. Spieltag | 23.11.2008 | KAA Gent | - | KRC Genk | 2:3 |  |
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| 15. Spieltag | 07.12.2008 | KV Kortrijk | - | KRC Genk | 3:1 | ||||
| 16. Spieltag | 13.12.2008 | KRC Genk | - | Sporting Charleroi | 1:0 | ||||
| 17. Spieltag | 19.12.2008 | RSC Anderlecht | - | KRC Genk | 2:0 | ||||
| 18. Spieltag | 18.01.2009 | Germinal Beerschot | - | KRC Genk | 4:1 | ||||
| 19. Spieltag | 24.01.2009 | KRC Genk | - | RAEC Mons | 2:0 | ||||
| 20. Spieltag | 01.02.2009 | Sporting Lokeren | - | KRC Genk | 1:2 |
Belgien