# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 16 10 3 3 35:24 11 33
2 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 16 9 2 5 32:18 14 29
3 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 16 9 1 6 30:28 2 28
4 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 16 7 2 7 21:19 2 23
5 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 16 9 2 5 22:19 3 22
6 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 16 6 4 6 29:29 0 22
7 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 16 4 6 6 24:22 2 18
8 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 16 4 5 7 15:21 -6 17
9 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 16 4 5 7 14:22 -8 17
10 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 16 1 4 11 8:28 -20 7
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.